用語解説
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分子力場開く
分子力場
タンパク質や核酸、薬剤との複合体などの計算では溶媒も含めると数万から数十万原子が含まれる。量子化学に基づく第一原理計算は適用できないサイズであるため、経験的ポテンシャル(分子力場)などを用いた古典力学に基づく計算を行う。生体分子については、AMBER, CHARMM, OPLSなどの既存力場を用いる事が多い。
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分子動力学計算開く
分子動力学計算
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拡張アンサンブル法開く
拡張アンサンブル法
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ハイブリッドQM/MM自由エネルギー法開く
ハイブリッドQM/MM自由エネルギー法
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粗視化モデル開く
粗視化モデル
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創薬計算フロー開く
創薬計算フロー
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バーチャル化合物開く
バーチャル化合物
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化合物ライブラリー開く
化合物ライブラリー
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リード化合物開く
リード化合物
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Hit to Lead開く
Hit to Lead
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化学構造変換手法(De novo、FBDDなど)開く
化学構造変換手法(De novo、FBDDなど)
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ホモロジーモデリング開く
ホモロジーモデリング
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ドッキング計算開く
ドッキング計算
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ADMET
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アッセイ情報
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オミクス開く
オミクス
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パスウェイ情報
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X線小角散乱(Small-Angle X-ray Scattering=SAXS)開く
X線小角散乱(Small-Angle X-ray Scattering=SAXS)
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X線結晶構造解析開く
X線結晶構造解析
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プロテオーム解析
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メタボローム解析
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構造ゲノム解析開く
構造ゲノム解析
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マルコフ連鎖モンテカルロ法
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