薬剤が不整脈を誘発するリスクを予測するために心筋イオンチャネルに対する薬剤の親和性を予測する
心毒性予測システム
寺田 透(東京大学大学院情報学環 准教授)
寺田 透(東京大学大学院情報学環 准教授)
根上 樹(東京大学大学院農学生命科学研究科)
薬剤が不整脈を誘発するリスクを予測するために心筋イオンチャネルに対する薬剤の親和性を予測する。
与えられた薬剤について、心筋イオンチャネルの細孔ドメインに対する結合自由エネルギーの値を予測する。ここで得られた値をIC50値に変換し、ヒル係数(多くの場合1)とともに株式会社UT-Heart研究所が無償で公開している3D hazard map (http://ut-heart.com/ECGdata/3d/index.php)に入力することで、不整脈を誘発するリスクを予測することができる。現時点では、心筋イオンチャネルのうち、カリウムチャネルhERG (IKr)とナトリウムチャネルNaV1.5 (INa)に対する結合自由エネルギーの値の予測のみが可能である。
T. Negami, M. Araki, Y. Okuno, and T. Terada: "Calculation of absolute binding free energies between the hERG channel and structurally diverse drugs"
準備中
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寺田 透(tterada@iu.a.u-tokyo.ac.jp)